Soğuk bir Eskişehir gününde, üç arkadaşın kâğıttan uçaklarla başlayan hayalleri, onları emekli bir uçak astsubayı olan Seyit Amca'nın sihirli dünyasına taşır. Ahmet, Emre ve Öykü için bahçedeki küçük bir kulübe, kısa sürede kocaman bir "Havacılık Akademisi"ne dönüşür.

Bu akademide çocuklar, yalnızca bir uçağın nasıl onarılacağını değil, aynı zamanda dostluğun, takım çalışmasının ve azmin önemini de öğrenirler. Vecihi Hürkuş'un ilham veren hikayesinden Cengiz Topel'in kahramanlığına, Sabiha Gökçen'in cesaretinden Wright Kardeşler'in tarihi uçuşuna uzanan bu yolculukta, en büyük keşifleri hayallerinin peşinden gitmenin ne kadar değerli olduğudur.

Havacılık Akademisi, gökyüzüne merakla bakan tüm çocuklara ve içindeki çocuğu yaşatan herkese, bir hayalin nasıl kanatlanıp uçabileceğinin sıcacık öyküsünü anlatıyor.